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제105회 대한화학회 학술발표회, 총회 및 기기전시회 안내 iPE-MMR: An integrated approach to accurately assign monoisotopic precursor masses to tandem mass spectrometric data

등록일
2010년 2월 24일 18시 20분 42초
접수번호
1347
발표코드
35P96포 이곳을 클릭하시면 발표코드에 대한 설명을 보실 수 있습니다.
발표시간
금 <발표Ⅳ>
발표형식
포스터
발표분야
분석화학
저자 및
공동저자
정희정, 김호근1, 형석원, 박종문, 문동기, 김경철2, 김수진, 이상원
고려대학교 화학과, Korea
1고려대학교 고려대 화학과, Korea
2고려대학교 화학, Korea
Accurate assignment of monoisotopic precursor masses to tandem mass spectrometric (MS/MS) data is a fundamental and important step for successful peptide identifications in mass spectrometry based proteomics. Here we describe an integrated approach that combines three previously reported methods of treating MS/MS data for precursor mass refinement. This combined method, “integrated Post-Experiment Monoisotopic Mass Refinement” (iPE-MMR), integrates steps: 1) generation of refined MS/MS data by DeconMSn, 2) additional refinement of the resultant MS/MS data by a modified version of PE-MMR, and 3) elimination of systematic errors of precursor masses using DtaRefinery. By combining the synergistic features of each method, iPE MMR increases sensitivity and accuracy in peptide identification when applied to complex high-throughput proteomics data. iPE-MMR also allows incorporating additional data processing step(s) or skipping step(s), if necessary, to enable new developments or applications of the tools, as each step of iPE MMR produces output data in a common and conventional format used in proteomics data processing.

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