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A study on the effect of electric field on DNA separation with a 24-channel short capillary electrophoresis chip

등록일: 2005년 8월 11일 11시 57분 32초
접수번호: 0805
발표코드: Ⅰ24P131포 이곳을 클릭하시면 발표코드에 대한 설명을 보실 수 있습니다.
발표시간: 금 <발표Ⅰ>
발표형식: 포스터
발표분야: 생명화학
저자 및 공동저자: 김영호, 박상열¹
경북대학교 생화학과,
¹한국표준과학연구원 유기생물분석그룹,

분리채널의 길이가 매우 짧은 다중채널 DNA 전기영동칩은 유전자분석 고속화의 주요 수단이 될 것으로 기대된다. 짧은 분리관을 사용한 DNA 분리에서 가해진 전기장의 세기가 분리속도 및 분리능에 미치는 효과를 체계적으로 조사하여 이를 분리조건 최적화의 기초로 삼고자 하였다. 본 연구에서는 전체 분리관의 길이가 3 cm에 불과한 24채널 전기영동칩에서 모델 DNA 혼합물의 분리에 전기장의 세기가 미치는 영향을 조사하였다. 모델 DNA 혼합물은 60, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000 bp 길이의 10종의 이중나선 DNA 혼합물이었다. DNA 분리용 sieving medium으로는 2% Polyethylene oxide (PEO, 분자량 8 M Da)를 사용하였고 TBE 용액을 완충용액으로 사용하였다. 전기영동의 전기장의 세기를 각각 8, 16, 25, 33, 66, 100, 133 V/cm로 하였을 때 이에 따라 분리속도 및 분리능이 어떻게 영향을 받는지 조사하였다. 8 V/cm에서 133V/cm의 넓은 전기장 범위에 걸쳐 전기장의 세기와 이동속도는 직선적 관계를 유지하였다. 100 V/cm 이상 가하였을 경우에 600 bp 보다 큰 유전자 시료의 분리가 이루어지지 않았다. 분리대상 유전자의 크기에 따라 분리속도와 분리능의 상충관계를 고려한 전기장 세기의 최적화가 필요하다.

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