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제117회 대한화학회 학술발표회, 총회 및 기기전시회 안내 Probing structural changes of self-assembled i-motif DNA

등록일
2016년 2월 25일 15시 47분 04초
접수번호
2006
발표코드
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발표시간
4월 21일 (목요일) 11:00~12:30
발표형식
포스터
발표분야
생명화학
저자 및
공동저자
이일준, Sachin P. Patil1, Niveen M. Khashab1, 김동은*
건국대학교 생명공학과, Korea
1King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Kingdom of Saudi Arabia, Korea
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승인 2건

We report an i-motif structural probing system based on Thioflavin T (ThT) as a fluorescent sensor. This probe can discriminate the structural changes of RET and Rb i-motif sequences according to pH change. We have discovered an interesting relation between ThT and i-motif sequences (RET and Rb) for probing conformational changes. More importantly, there are dramatic changes measured in the fluorescence emission spectra of the ThT with i1 (RET) and i2 (Rb) upon its structural transition from random coil to i-motif structure. The fluorescence patterns are opposite because of the cavity but follow the patterns of the CD spectra exactly. More experimentation is currently underway to expand the scope of the work by testing different structural mutations to better explain the mechanism of interaction. This simple system is useful for probing i-motif structures and should assist in the development of stable DNA-based nanostructures.


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