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  학술발표회 - 초록 상세보기

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등록일 2017년 08월 24일 15시 56분 02초
접수번호 1910
발표코드 PHYS.O-3 이곳을 클릭하시면 발표코드에 대한 설명을 보실 수 있습니다.
발표시간 목 09시 : 20분
발표형식 구두발표
발표분야 Physical Chemistry - Oral Presentation for Young Scholars in Physical Chemistry
저자 및 공동저자 Juyong Lee
Department of Chemistry, Kangwon National University, Korea
제목 Finding multiple reaction pathways via global optimization of action
내용

We present a new computational approach, Action-CSA, to sample multiple reaction pathways with fixed initial and final states through global optimization of the Onsager-Machlup action using the conformational space annealing method. This approach successfully samples not only the most dominant pathway but also many other possible paths without initial guesses on reaction pathways. Pathway space is efficiently sampled by crossover operations of a set of paths and preserving the diversity of sampled pathways. The sampling ability of the approach is assessed by finding pathways for the conformational changes of alanine dipeptide and hexane. The benchmarks demonstrate that the rank order and the transition time distribution of multiple pathways identified by the new approach are in good agreement with those of long molecular dynamics simulations. We also show that the lowest action folding pathway of the mini-protein FSD-1 identified by the new approach is consistent with previous molecular dynamics simulations and experiments.

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