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Development MWcorr from definition of positive-distribution using RSDB in proteome analysis bacteria on MS/MS

등록일: 2005년 2월 17일 11시 56분 04초
접수번호: 0842
발표코드: Ⅱ23P179포 이곳을 클릭하시면 발표코드에 대한 설명을 보실 수 있습니다.
발표시간: 금 <발표Ⅱ>
발표형식: 포스터
발표분야: 생명화학
저자 및 공동저자: 박건욱, 김진영, 조건, 이정화, 유종신
한국기초과학지원연구원 프로테오믹스팀,

Proteomics is the research field where it is possible to produce the high-throughput proteome data in high speed. In this study, we got the MS/MS spectra for the Pseudomonas putida KT2440 sample by LTQ/LTQ/MS and then computed the peptides identification by the database search software, SEQUEST using the computer server of 32 CPU SEQUEST-Cluster. We have found that these scores are not enough to distinguish the correct peptides from incorrect ones and we proposed another new descriptor, MWcorr to refine the SEQUEST result. MWcorr represents the protein correlation of molecular weight between the 1D-gel based experimental MW (MWexp) and the theoretical MW (MWcal) of predicted protein. This task necessarily definition exact region of MWcorr from statistical model of distribution true positive proteins.

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