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제114회 대한화학회 학술발표회, 총회 및 기기전시회 안내 Single-molecule study of the interaction between HindIII endonuclease and substituted DNA

등록일
2014년 8월 28일 13시 52분 44초
접수번호
0911
발표코드
PHYS.P-407 이곳을 클릭하시면 발표코드에 대한 설명을 보실 수 있습니다.
발표시간
10월 15일 (수요일) 16:00~19:00
발표형식
포스터
발표분야
물리화학
저자 및
공동저자
임영빈, 김성근1,*, 박소영1
서울대학교 생물물리 및 화학생물학과, Korea
1서울대학교 화학부, Korea
We studied the interaction of HindIII endonuclease with double-stranded DNA containing an AAGCTT segment, which substitutes various functional groups and is expected to be the interface between HindIII and its recognition sequence. We found that the introduction of a single substituent on the recognition site has only a small effect on binding of endonuclease. The dependence of the binding rate on the size of substituents shows a compensation relationship between the activation energy and pre-exponential factor. Different kinetics between normal vs. substituted DNA is caused by the unstable HindIII?DNA complex, which is consistent with the change in the standard free energy of the transition state. We propose that the effect of molecular changes on DNA recognition site is important in understanding how DNA modification modulates the cellular metabolism and functions of DNA binding proteins.

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