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FLI-DB : Fragment of protein-Ligand Interaction DataBase

등록일
2008년 2월 14일 11시 02분 05초
접수번호
1285
발표코드
33P247포 이곳을 클릭하시면 발표코드에 대한 설명을 보실 수 있습니다.
발표시간
목 <발표Ⅱ>
발표형식
포스터
발표분야
의약화학
저자 및
공동저자
전재경, 강남숙1, 채종학2
서울대학교 협동과정 생물정보학 전공 , 한국화학연구원 화합물은행,
1한국화학연구원 분자설계실,
2한국화학연구원 화합물은행,
3D Structure of the protein-ligand complex provides information on the interaction between residue of active site and small molecules. In small-molecule drug discovery, finding functional fragments which interact with protein residues is very import. Fragment-based approaches are of use to find lead molecules more efficiently and a rapidly growing field that offers advantages over traditional lead-discovery processes. Here we find active site residue from structure of protein-ligand complex, and fragment of ligand by distance from protein residue. By analyzing interaction between residues and fragments, we can gain more detailed knowledge about their conserved fragments interacted with residue and improve drug design efficiency by focusing on assign appropriate fragment. This article provides a summary of FLI-DB database, data contents, ligand classification, search options.

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